La Mediateca viene fondata dall’Associazione Culturale Visionaria presso la Corte dei Miracoli nel 1998.
Nel 2003 con un accordo firmato dal Comune di Siena, dall’Università di Siena, dalla ex Mediateca Regionale Toscana (dal 2010 fusa nella Fondazione Sistema Toscana) e da Visionaria, la Mediateca viene accolta al Santa Maria della Scala e diventa parte integrante della stessa Mediateca Regionale Toscana.
Nonostante gli oltre 8.000 lungometraggi e i 20.000 cortometraggi raccolti e nonostante le attività (corsi di formazione con le scuole del territorio, proiezioni universitarie, assistenza agli studenti per i materiali audiovisivi e molto altro), la Mediateca viene chiusa nel 2018, ma già da qualche anno la ex Mediateca Regionale aveva cessato ogni rapporto dichiarandosi non più interessata.